公司进行合同申报的原因主要包括以下几点：
遵守法律规定：
确保企业合规性，避免因违反税收法规而受到法律制裁。
保障国家财政收入：
通过合同申报，企业能够及时、准确地为国家提供资金，支持国家公共服务和基础设施建设。
规范管理：
合同申报要求企业规范财务管理，准确核算收入与支出，有助于加强内部管理，提高经济效益。
维护市场经济秩序：
确保所有企业在同一税收环境下竞争，避免因税收不公导致的市场扭曲。
此外，根据我国相关法律规定，公司成立后无论是否有收入，都应当在规定时间内进行税务登记和纳税申报，否则可能会面临罚款、滞纳金甚至税务登记证注销等后果。