职务犯罪的管辖部门主要根据犯罪主体的性质和职务犯罪的类型来确定。以下是具体的管辖部门：
监察委员会
一般情况：监察机关负责调查涉嫌贪污贿赂、滥用职权、玩忽职守、权力寻租、利益输送、徇私舞弊以及浪费国家资财等职务犯罪案件。
特殊情况：对于公职人员涉嫌职务违法和职务犯罪，一般由驻在主管部门、有管辖权的监察机构、监察专员管辖。经协商，监察机构、监察专员可以按规定移交公职人员工作单位所在地的地方监察委员会调查，或者与地方监察委员会联合调查。
人民检察院
一般情况：国家工作人员职务犯罪，归检察院管辖。
特殊情况：对于司法工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，监察机关和人民检察院均有权管辖。涉嫌上述犯罪的司法工作人员，如不涉嫌贪污贿赂等监察机关管辖的其他职务犯罪，一般由人民检察院立案侦査，必要时监察机关也可以立案调査。
公安机关
一般情况：其他人员的职务犯罪，归公安机关管辖，但贪污贿赂案件除外。
特殊情况：对于司法工作人员以外的公职人员利用职权实施的非法拘禁、虐待被监管人、非法搜查等侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪，由监察机关管辖。
建议
在实际案件中，确定职务犯罪的管辖部门需要综合考虑犯罪主体的身份、职务犯罪的性质以及具体案件的情节。对于涉及国家工作人员的职务犯罪，建议优先由人民检察院管辖；对于其他人员的职务犯罪，则根据具体情况由监察机关或公安机关管辖。